Di Jepang saat masa depan mendekat, tahun 2035. Insiden besar yang dikenal sebagai “Burst” yang terjadi karena meneliti AI. Suatu AI yang disebut “Matter” telah mengkikis Kurobe Gorge. Mengakibatkannya pelarangan memasuki kota penelitian, yang disebut sebagai harapan terakhir kemanusiaan. Dua tahun kemudian, Akio Tachibana, seorang gadis 15 tahun yang kehilangan keluarganya karena kejadian tersebut, bertemu dengan seorang siswa pindahan bernama Yuuya Kanzaki yang memberitahu kenyataan tentang rahasia dalam badan miliknya. Disebutkan bahwa kunci utama untuk mengungkap misteri ini berada di titik utama (Primary Point), di tengah Burst. Ketika seorang lelaki dan seorang perempuan, yang mengenggam masa depan kemanusiaan bertemu, akan seperti apakah kenyataan yang baru? [Written by MAL Rewrite]