Seorang ninja muda bernama Saizo Kirigakure sedang mencoba untuk menemukan makna dan arah dalam hidupnya. Saat itu ia bertemu dengan Isanami, wanita yang sedang lari dari kejaran pembunuh. Saizo berhasil menyelamatkan Isanami, dan Isanami kemudian meminta Saizo untuk bertindak sebagai pengawalnya sampai ia mencapai tujuannya. Ketika mereka tiba di wilayah Sanada, Saizo bertemu dengan Sasuke Sarutobi, pemimpin kelompok ninja yang terkenal. Sanada telah mengumpulkan para ninja berani dan berbakat bersama-sama untuk mengakhiri era perang di Jepang. Sementara itu, kekuatan misterius Isanami yang tersembunyi mulai terkuak.