10 tahun yang lalu, “Pandora Box” ditemukan di Mars. Di Bumi, ia menciptakan tembok yang membagi Jepang menjadi Touto (Ibukota Timur), Hokuto (Modal Utara) dan Seito (Ibukota Barat) dan membawa Smash, bentuk kehidupan tak dikenal yang menyerang orang. Sento Kiryu, fisikawan ajaib, berubah menjadi Kamen Rider Build untuk melawan Smash. Pemerintah Touto meminta bantuannya untuk menguraikan misteri di balik Pandora Box dan the Smash. Ada satu misteri yang bahkan tidak bisa diatasi Sento: masa lalunya sendiri. Satu-satunya kenangan yang dia tinggalkan lebih dari 20 tahun adalah adanya sosok jahat bernama Night Rogue. Ada satu orang yang memegang kunci kenangan Sento: Pelarian penjara dengan nama Ryuga Banjo, yang dengan tegas menyangkal melakukan pembunuhan yang dituduhkan kepadanya. Misora ​​Isurugi yang bekerja dengan Sento, memiliki kemampuan untuk memurnikan komponen berbahaya Smash.